Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF6P49848 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF6P49848 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms