Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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