Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIP4K2AP48426 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PIP4K2AP48426 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms