Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GJA4P35212 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJA4P35212 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJA4P35212 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJA4P35212 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms