Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXC13P31276 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms