Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA13P31271 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms