Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA6P31267 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms