Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRBP23467 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRBP23467 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRBP23467 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRBP23467 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRBP23467 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRBP23467 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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PTPRBP23467 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRBP23467 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRBP23467 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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