Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMP4P12644 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMP4P12644 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMP4P12644 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms