Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAMP11215 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms