Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD3P0DMS9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms