Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RCBTB2O95199 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms