Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms