Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPLO60437 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPLO60437 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPLO60437 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPLO60437 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms