Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCO2O43819 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms