Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCEO43556 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCEO43556 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCEO43556 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCEO43556 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCEO43556 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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SGCEO43556 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCEO43556 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCEO43556 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCEO43556 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCEO43556 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCEO43556 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCEO43556 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCEO43556 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCEO43556 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCEO43556 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCEO43556 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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