Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms