Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms