Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP17L12C9JPN9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms