Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP73A6NFT4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP73A6NFT4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms