Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB19A4D1S5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms