Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SSPOA2VEC9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SSPOA2VEC9 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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