Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAXBP1Q9Y5B6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms