Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF6Q9Y4K3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms