Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms