Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3M1Q9Y2T2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms