Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED13Q9UHV7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED13Q9UHV7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms