Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms