Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms