Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX1-2Q9UD57 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms