Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms