Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms