Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2AFY2Q9P0M6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2AFY2Q9P0M6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2AFY2Q9P0M6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2AFY2Q9P0M6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2AFY2Q9P0M6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2AFY2Q9P0M6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2AFY2Q9P0M6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2AFY2Q9P0M6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2AFY2Q9P0M6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms