Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms