Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EHD3Q9NZN3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms