Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms