Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARFGAP3Q9NP61 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms