Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLIRPQ9GZT3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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