Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE41Q9C0J9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms