Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMBRA1Q9C0C7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms