Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms