Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADM1Q9BY67 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CADM1Q9BY67 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms