Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms