Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms