Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRACR2AQ9BSW2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRACR2AQ9BSW2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms