Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms