Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms