Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF354BQ96LW1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF354BQ96LW1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms