Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms