Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC41A2Q96JW4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms